MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus gallolyticus UCN34 chromosome

Total Repeats: 7682

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013798	A	6	6	7	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013798	CTTT	2	8	40	47	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013798	T	6	6	89	94	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013798	T	6	6	121	126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013798	ACT	2	6	164	169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013798	GTT	2	6	1569	1574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013798	AAC	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013798	CG	3	6	1587	1592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013798	CAA	2	6	1618	1623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013798	CTA	5	15	1636	1650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013798	TAA	2	6	1661	1666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013798	GAA	2	6	2842	2847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013798	CTTTT	2	10	2873	2882	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013798	TAA	2	6	2943	2948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013798	AAT	2	6	4047	4052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013798	TA	3	6	4090	4095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013798	AAT	2	6	4147	4152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013798	ATTA	2	8	5295	5302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013798	A	6	6	5320	5325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013798	GGAAA	2	10	5353	5362	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013798	AGG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013798	AGG	2	6	10126	10131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013798	CT	3	6	10139	10144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013798	TTA	2	6	10146	10151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013798	A	7	7	10191	10197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013798	GTT	2	6	17826	17831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013798	T	7	7	17830	17836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013798	ATT	2	6	17837	17842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013798	T	7	7	17892	17898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013798	CTCC	2	8	17986	17993	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_013798	CAA	2	6	18039	18044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013798	AGA	2	6	18066	18071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013798	A	6	6	18149	18154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013798	GAT	2	6	18177	18182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013798	TGT	2	6	18196	18201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013798	GCG	2	6	18213	18218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013798	A	7	7	18242	18248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013798	AGT	2	6	18257	18262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013798	AAAT	2	8	18378	18385	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013798	GGC	2	6	18449	18454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013798	ACT	2	6	18483	18488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013798	CTA	2	6	18546	18551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013798	TAG	2	6	18639	18644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013798	TGG	2	6	18670	18675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013798	CGA	2	6	18694	18699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013798	GCA	2	6	18768	18773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013798	CGC	2	6	18815	18820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013798	GTGA	2	8	18821	18828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013798	TGT	2	6	18854	18859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013798	AGA	2	6	18863	18868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013798	GT	3	6	18871	18876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013798	CA	3	6	18891	18896	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013798	CAG	2	6	18937	18942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013798	AGCG	2	8	18992	18999	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013798	TAA	2	6	19009	19014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013798	AT	3	6	19121	19126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013798	GGA	2	6	19127	19132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013798	CT	3	6	19152	19157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013798	GAA	2	6	19391	19396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013798	TTC	2	6	19444	19449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013798	GGT	2	6	19465	19470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013798	GTC	2	6	19479	19484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013798	TCGTG	2	10	19488	19497	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013798	CAT	2	6	19547	19552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013798	TAA	2	6	19582	19587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013798	GGA	2	6	19591	19596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013798	ATC	2	6	19615	19620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013798	AC	3	6	19642	19647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013798	TGGT	2	8	19657	19664	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013798	GCAA	2	8	19689	19696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013798	CGC	2	6	19781	19786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013798	AC	3	6	19811	19816	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_013798	CAC	2	6	19826	19831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013798	AGCC	2	8	19874	19881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013798	GAT	2	6	19897	19902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013798	CCT	2	6	19953	19958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_013798	A	6	6	19967	19972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013798	AGG	2	6	20058	20063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013798	AAT	2	6	20159	20164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013798	AGA	2	6	20220	20225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013798	GTTAA	2	10	20236	20245	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013798	ACG	2	6	20299	20304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013798	GTAA	2	8	20322	20329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013798	TAG	2	6	20470	20475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013798	GCGA	2	8	20478	20485	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013798	AGA	2	6	20557	20562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013798	AG	3	6	20585	20590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013798	TCG	2	6	20660	20665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013798	GGA	2	6	20673	20678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013798	CT	3	6	20699	20704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013798	GGGAG	2	10	20754	20763	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013798	ACA	2	6	20791	20796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013798	ATG	2	6	20858	20863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013798	GGC	2	6	20913	20918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013798	TC	3	6	21077	21082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_013798	TTGA	2	8	21138	21145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013798	ACC	2	6	21256	21261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013798	AT	3	6	21277	21282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013798	AGC	2	6	21336	21341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013798	ATTC	2	8	21343	21350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013798	TG	3	6	21464	21469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013798	AAG	2	6	21470	21475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013798	GAG	2	6	21485	21490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013798	GA	3	6	21615	21620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013798	TA	3	6	21669	21674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013798	AGG	2	6	21679	21684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013798	CTAA	2	8	21696	21703	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013798	GA	3	6	21910	21915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013798	CT	3	6	22026	22031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013798	GAT	2	6	22044	22049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013798	TTAGCG	2	12	22097	22108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013798	CGG	2	6	22135	22140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013798	GA	3	6	22233	22238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013798	TAGG	2	8	22351	22358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013798	GTT	2	6	22395	22400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013798	TAC	2	6	22405	22410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013798	CCT	2	6	22493	22498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013798	GGT	2	6	22629	22634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013798	TCG	2	6	22744	22749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013798	CGT	2	6	22824	22829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013798	AGGGA	2	10	22962	22971	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013798	GA	3	6	23048	23053	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013798	GTG	2	6	23084	23089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013798	ACTAAT	2	12	23103	23114	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013798	AT	3	6	23176	23181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013798	AATC	2	8	23204	23211	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013798	TGA	2	6	23221	23226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013798	CAG	2	6	23262	23267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013798	AGT	2	6	23288	23293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013798	AAG	2	6	23411	23416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013798	GTG	2	6	23437	23442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013798	TAA	2	6	23672	23677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013798	CGT	2	6	23834	23839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_013798	TAA	2	6	23945	23950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013798	CGC	2	6	24178	24183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013798	AT	3	6	24280	24285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013798	AT	3	6	24290	24295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013798	GGA	2	6	24304	24309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013798	GCGT	2	8	24363	24370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013798	TCC	2	6	24387	24392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_013798	TTG	2	6	24400	24405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013798	AGC	2	6	24417	24422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013798	TCG	2	6	24431	24436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_013798	CGG	2	6	24533	24538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013798	ATTA	2	8	24558	24565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013798	TAT	2	6	24569	24574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013798	TGT	2	6	24614	24619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_013798	GGA	2	6	84700	84705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_013798	CGG	2	6	84929	84934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_013798	AAT	2	6	85765	85770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_013798	T	7	7	88796	88802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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